Η ΦΚ Καραμπαχ, που ήρθε στο δρόμο του ΠΑΟΚ, δεν είναι μια συνηθισμένη ομάδα.
Είναι στην πραγματικότητα μια προσφυγική ομάδα, που άφησε τον τόπο της, το Αγκντάμ του πολύπαθου Ναγκόρνο Καραμπάχ κι αναγκάστηκε να μετακομίσει στο Μπακού, μετά τον πόλεμο που ξέσπασε εκεί, ανάμεσα σε Αζέρους και Αρμένιους, που το διεκδικούν.
Η διαμάχη για το Ναγκόρνο Καραμπάχ κρατά σχεδόν έναν αιώνα, και αναζωπυρώθηκε στα χρόνια της Περεστρόικα. Η περιοχή, επί Σοβιετικής Ένωσης, άνηκε στα όρια του Αζερμπαϊτζάν, αλλά το 1988 ξέσπασε πόλεμος, ανάμεσα σε Αρμένιους και Αζέρους.
Το Ναγκόρνο Καραμπάχ ανακοίνωσε την αποχώρησή του από το Αζερμπαϊτζάν, και ξεκίνησε ο πόλεμος, με τους Αρμένιους να υποστηρίζουν την ημι-αυτονομία της περιοχής, υπό τη δική τους σκέπη.
Το 1994 το Αζερμπαϊτζάν έχασε τον έλεγχο της περιοχής κι αποφασίστηκε κατάπαυση του πυρός, αλλά η περιοχή ποτέ δεν ηρέμησε και η φωτιά δεν έσβησε.
Το 1993, η Καραμπάχ επέλεξε να φύγει από το Αγκντάμ, και να μετακομίσει στο Μπακού, αφού το γήπεδό της, όπως και όλη η πόλη ισοπεδώθηκε και ακόμη και σήμερα παραμένει μια πόλη φάντασμα. Μάλιστα ο προπονητής της μέχρι το 1992, Αλαχβερντί Μπαγκίροφ σκοτώθηκε από αντιαρματική νάρκη και θεωρείται σήμερα εθνικός ήρωας.
Η ΦΚ Καραμπάχ αντιμετώπισε πολλά προβλήματα φεύγοντας από την κατεστραμένη πόλη της, αλλά το 2001 την έσωσε η εταιρία Azersun, που ανέλαβε χορηγός της.
Αποκαλείται “ομάδα πρόσφυγας” και έχει πολλές συμπάθειες στο Αζερμπαϊτζάν, καθώς είναι η μοναδική ομάδα, που εκπροσωπεί την πολύπαθη περιοχή του Ναγκόρνο Καραμπάχ.
